技術(shù)文章
Technical articles賽默飛 ViiA™ 7 實(shí)時熒光定量 PCR 儀器技術(shù)介紹
一、儀器概述
ViiA™ 7 實(shí)時熒光定量 PCR 系統(tǒng)是 Thermo Fisher Scientific 推出的多功能實(shí)時定量 PCR 平臺之一,集成了高通量檢測能力、靈活配置模塊與圖形化操作系統(tǒng),適用于基因表達(dá)分析、基因分型、SNP檢測、拷貝數(shù)變異(CNV)分析、路徑分析等分子生物學(xué)研究場景。
該系統(tǒng)支持多種反應(yīng)格式,包括96孔、384孔和TaqMan Array卡等,實(shí)現(xiàn)從中低通量到大規(guī)模篩查的實(shí)驗(yàn)需求。結(jié)合其配套的QuantStudio軟件平臺,能夠完成實(shí)時熒光采集、定量分析與結(jié)果可視化。
二、主要技術(shù)參數(shù)與配置
反應(yīng)孔板兼容性
支持96孔板、384孔板;
支持TaqMan Array Microfluidic Card(8×12通道);
可選擇不同反應(yīng)模塊進(jìn)行更換,提升通量靈活性;
單次反應(yīng)體系體積范圍:10–100 µL(96孔)、5–20 µL(384孔)、1–10 µL(Array卡)。
溫控系統(tǒng)
Peltier溫控模塊;
升溫速率:≥4.0°C/s;
降溫速率:≥3.5°C/s;
溫度準(zhǔn)確性:±0.25°C;
溫度均一性(96孔):<0.4°C;
可控?zé)嵘w,適應(yīng)不同板型,避免樣本蒸發(fā)。
光學(xué)檢測系統(tǒng)
采用高亮度LED激發(fā)源,延長壽命、降低維護(hù)頻率;
標(biāo)準(zhǔn)配置6通道檢測系統(tǒng)(支持FAM, VIC, NED, ROX, SYBR Green等);
自適應(yīng)熒光通道校準(zhǔn)機(jī)制,避免通道串?dāng)_;
實(shí)時采集數(shù)據(jù),每循環(huán)一個周期自動記錄熒光信號;
具有無接觸光學(xué)掃描設(shè)計(jì),避免物理磨損。
軟件系統(tǒng)(QuantStudio/Cloud支持)
實(shí)驗(yàn)設(shè)置模塊:支持模板選擇、程序編輯與快速啟動;
數(shù)據(jù)分析模塊:具備Ct值計(jì)算、ΔΔCt相對表達(dá)分析、熔解曲線分析等;
多用戶權(quán)限與實(shí)驗(yàn)加密管理;
兼容云端平臺,實(shí)現(xiàn)遠(yuǎn)程實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與數(shù)據(jù)查看;
支持SNP判定、標(biāo)準(zhǔn)曲線自動生成、樣本分組和統(tǒng)計(jì)分析;
數(shù)據(jù)導(dǎo)出格式:Excel、CSV、PDF、圖像等多種方式。
三、工作原理
ViiA™ 7 基于實(shí)時熒光PCR原理,通過熒光探針(如TaqMan探針)或染料(如SYBR Green)標(biāo)記擴(kuò)增產(chǎn)物,在擴(kuò)增過程中記錄熒光信號強(qiáng)度變化,建立擴(kuò)增曲線,從而實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)核酸序列的定量分析。
其工作流程主要包括以下幾步:
樣本制備
配置PCR反應(yīng)體系,包括模板、引物、熒光探針或染料、酶體系和緩沖液;
分裝至96/384孔板或Array卡中。
PCR擴(kuò)增與熒光采集
儀器通過預(yù)設(shè)程序進(jìn)行熱循環(huán)擴(kuò)增;
每一循環(huán)末期采集熒光強(qiáng)度,生成實(shí)時擴(kuò)增曲線;
根據(jù)熒光閾值計(jì)算Ct值(Cycle threshold),反映起始模板濃度。
數(shù)據(jù)分析
軟件自動判斷擴(kuò)增效率、背景噪音、熒光漂移;
生成標(biāo)準(zhǔn)曲線或進(jìn)行相對定量分析;
對目標(biāo)基因表達(dá)水平或基因分型進(jìn)行判定。
四、儀器組成與模塊化設(shè)計(jì)
ViiA™ 7 實(shí)時定量PCR儀采用模塊化設(shè)計(jì),用戶可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇以下組件:
主機(jī)
集成溫控模塊與光學(xué)檢測系統(tǒng);
配備可更換反應(yīng)模塊(96孔、384孔、Array卡);
支持自動識別并適應(yīng)不同板型。
控制系統(tǒng)
通過配套電腦或QuantStudio軟件進(jìn)行全程控制;
可連接實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS);
耗材系統(tǒng)
標(biāo)準(zhǔn)0.2 mL PCR板;
384孔板與封膜;
TaqMan Array卡和加載夾具;
配套服務(wù)
可選自動液體處理系統(tǒng)連接;
提供安裝培訓(xùn)與定期維護(hù)支持;
軟件更新與在線技術(shù)資源支持。
五、典型應(yīng)用實(shí)例
基因表達(dá)譜分析
比較實(shí)驗(yàn)處理組與對照組之間的目標(biāo)基因表達(dá)變化;
可與RNA提取和cDNA合成體系配套使用;
支持多重定量與多基因比較。
SNP基因分型
采用TaqMan探針識別單堿基變異;
實(shí)時檢測等位基因信號,區(qū)分純合/雜合型;
廣泛應(yīng)用于藥物代謝、遺傳疾病篩查等領(lǐng)域。
病毒與病原體載量檢測
檢測病毒RNA/DNA濃度,如HBV、HCV、HIV、SARS-CoV-2等;
可與預(yù)構(gòu)建探針試劑盒搭配,進(jìn)行絕對定量分析;
滿足疾病篩查、診斷與療效評估需求。
miRNA與lncRNA定量分析
適用于小RNA或長鏈非編碼RNA表達(dá)研究;
軟件支持歸一化分析與多目標(biāo)比較;
與miRNA反轉(zhuǎn)錄引物聯(lián)合使用可提高檢測靈敏度。
拷貝數(shù)變異(CNV)分析
用于分析特定基因的DNA拷貝數(shù)變化;
常用于腫瘤學(xué)、基因組完整性評價等研究方向。
六、操作注意事項(xiàng)與維護(hù)建議
實(shí)驗(yàn)操作
確保板面干凈、封膜緊密,避免蒸發(fā)或污染;
熱蓋需根據(jù)板型調(diào)節(jié)高度與壓力;
建議使用ROX作為內(nèi)參染料,修正熒光漂移。
維護(hù)保養(yǎng)
定期檢查光源穩(wěn)定性與濾光片清潔度;
長時間停機(jī)前應(yīng)進(jìn)行數(shù)據(jù)備份與系統(tǒng)清理;
定期更新軟件以獲取新功能與增強(qiáng)兼容性。
常見問題
熒光信號漂移:檢查板密封性與反應(yīng)體系;
信號偏低:優(yōu)化引物、模板濃度與酶體系;
無擴(kuò)增:排查酶活性、程序設(shè)置與試劑有效性。
七、總結(jié)與適配場景分析
ViiA™ 7 實(shí)時熒光定量 PCR 系統(tǒng)憑借其多模塊兼容、通量靈活、軟件功能全面等特點(diǎn),適用于基礎(chǔ)分子生物學(xué)研究、高通量基因篩查、臨床科研輔助分析等多種場景。系統(tǒng)提供標(biāo)準(zhǔn)化操作流程與多通道檢測支持,便于實(shí)驗(yàn)室在多種檢測方案間靈活切換,并能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的快速分析與管理。
其設(shè)計(jì)充分考慮實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性、重現(xiàn)性與效率,特別適合于需要批量處理樣本并開展大規(guī)模數(shù)據(jù)分析的研究平臺,如:
醫(yī)學(xué)院校教學(xué)實(shí)驗(yàn)室;
疾控機(jī)構(gòu)的流行病檢測;
醫(yī)療機(jī)構(gòu)的病原核酸檢測;
藥企或生物技術(shù)公司開發(fā)階段的生物標(biāo)志物篩選。